Ingénieur en Biologie Moléculaire et Analyses de Données H/F - 34

Une mission attractive

Sous la responsabilité de Christèle Humblot chercheure à l'IRD spécialiste en microbiologie, votre missionà consistera à choisir, adapter et mettre en oeuvre les méthodes nécessaires à la réalisation des activités de recherche de l'UMR dans le domaine de l'écologie microbienne moléculaire

vos activités seront les suivantes :
- Assurer la veille méthodologique et la mise au point de méthodes en métagénomique (écologie synthétique, cultures microbiennes, approches « méta-omiques », préparation, suivi et contrôle des opérations de fermentation).
- Réaliser des analyses de routine en biologie moléculaire (extraction ADN, ARN, PCR en temps réel, séquençage à haut débit).
- Conduire les analyses de données issues du séquençage à haut débit (métagénomes alimentaires et intestinaux) en utilisant des outils de bio-informatique (Qiime 2, R, Python, Bash) y compris sur des clusters de calcul, du traitement des données à la visualisation.
- Favoriser l'articulation avec les structures opérationnelles et décisionnelles (plateformes de séquençage à haut débit, interactions avec les centres de ressources microbiennes).
- Rédiger des protocoles détaillés d'analyse et former les stagiaires et partenaires.
- Respecter et faire respecter les règles d'éthique, d'hygiène et sécurité.
- Participer à la gestion du laboratoire (commandes, suivi des stocks, maintenance)

Votre future équipe

Vous intègrerez une équipe multidisciplinaire composée de 6 chercheurs, 1 ingénieur de recherche, 2 ingénieurs d'études 1 assistant ingénieur et 1 technicien. La multidisciplinarité des approches développées (épidémiologie, science des aliments) vous permettra d'interagir avec des collègues de différents domaines, tout en renforçant les aspects microbiologiques portés principalement par un chercheur de l'équipe.

Vous travaillerez en interactions fortes avec les membres de cette équipe ayant un effectif de taille restreinte ainsi qu'avec des membres d'autres équipes de l'UMR (par exemple en bioinformatique).

Vous partagerez un espace commun pour mener à bien les activités qui vous seront confiées, dans un collectif engagé et volontaire.

Vous interagirez avec des partenaires et étudiants du Sud dans un environnement multiculturel.