Ingénieur en Développement Web H/F - 34

Vous rejoindrez le projet BRIDGE-COFFEA (financé par l'ANR), porté par (IRD, CIRAD, Université de Montpellier ), et accueilli dans l'unité partenaire (CIRAD, INRAE, Institut Agro et Université de Montpellier ). Ces deux unités étudient différents modèles de plantes tropicales et méditerranéennes, leur fonctionnement, leur adaptation et leur diversité.Une mission attractive

Sous la supervision du coordinateur BRIDGE-COFFEA et chercheur en génomique des caféiers, votre mission principale consistera à concevoir et développer des outils web interactifs de visualisation de données génomiques, intégrant notamment des représentations de pangénomes, de structures génétiques, et de relations phylogénétiques.

Ces visualisateurs auront pour objectif de faciliter l'exploration, la comparaison et l'interprétation des jeux de données produits par les équipes scientifiques du projet. Ils seront pensés pour être utilisés à la fois par des chercheurs spécialistes et des partenaires scientifiques du Sud.

Ce poste s'inscrit pleinement dans une dynamique de recherche ouverte, interdisciplinaire et partenariale, au service d'une meilleure compréhension de la biodiversité génomique des caféiers et de ses applications en amélioration variétale et conservation. Vous serez amené à réemployer certains visualisateurs et logiciels existants.

Dans ce cadre vos activités seront les suivantes:

- Concevoir et développer des outils web interactifs de visualisation de données génomiques (pangénomes, structures génétiques, phylogénies), incluant des interfaces frontend ergonomiques et performantes pour l'exploration de jeux de données complexes.
- Développer les composants backend nécessaires à l'accès, au traitement et à la structuration des données (APIs, services applicatifs), ainsi que la mise en place et l'interrogation de bases de données relationnelles et/ou NoSQL.
- Assurer la préparation, la transformation et l'optimisation des données scientifiques en vue de leur visualisation et de leur exploitation.
- Adapter, intégrer et réemployer des outils ou visualisateurs existants en fonction des besoins du projet.
- Documenter les développements, garantir la qualité du code et contribuer à la pérennisation des outils produits.

Votre future équipe

Vous serez intégré à la fois à l'équipe et à l'équipe sur le site de Lavalette, Montpellier.