Thèse Approche Intégrative des Effecteurs de l'Incompatibilité Cytoplasmique Induite par Wolbachia chez les Moustiques H/F - 34

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : GAIA - Biodiversité, Agriculture, Alimentation, Environnement, Terre, Eau
Laboratoire de recherche : DGIMI - Diversité, Génomes & Interactions Microorganismes-Insectes
Direction de la thèse : Anne-Sophie GOSSELIN-GRENET ORCID 0000000308195626
Début de la thèse : 2026-11-01
Date limite de candidature : 2026-05-07T23:59:59

L'incompatibilité cytoplasmique (IC) est le principal mécanisme assurant la transmission verticale de Wolbachia chez leurs hôtes, à savoir plus de 50 % des espèces d'arthropodes. Dans le cas de l'IC, les oeufs non infectés par Wolbachia ne se développent pas lorsqu'ils sont fécondés par le sperme de mâles infectés. Seules les femelles infectées, dont les oeufs hébergent Wolbachia, produisent des embryons viables avec des mâles infectés par la même souche de Wolbachia. L'IC est utilisée dans la lutte antivectorielle, notamment contre les moustiques, par le biais de la technique de l'insecte incompatible. Les effecteurs de d'IC sont les gènes appelés cif, organisés en opérons A-B. Chacun des gènes d'un opéron cif appartient à une famille multigénique monophylétique, diversifiée en 10 grands types. L'amélioration récente des techniques de séquençage à haut débit, notamment celles produisant des long reads, a permis l'assemblage de génomes de Wolbachia induisant l'IC chez les arthropodes dont ceux des moustiques communs (Culex pipiens) et du moustique tigre (Aedes albopictus). La plupart de ces génomes hébergent dans différentes zones prophagiques des opérons cif appartenant à différents types, soulevant la question du rôle et de l'évolution de cette diversité d'effecteurs cif au sein d'un même génome de Wolbachia.
Objectifs : Pourquoi différents gènes cif sont-ils maintenus au sein d'un même génome de Wolbachia ? Quelle est la contribution des différents types de cif au mécanisme d'IC chez les moustiques ? Quels défauts embryonnaires chacun provoque-t-il ?
Afin de répondre à ces questions, ce projet de thèse s'appuie sur une approche intégrative combinant des approches évolutives et fonctionnelles de l'IC chez les moustiques (génomique de Wolbachia, caractérisation des phénotypes d'IC grâce à des croisements entre lignées de moustiques, distribution des protéines dans les organes reproducteurs et les gamètes).

L'incompatibilité cytoplasmique (IC) est le principal mécanisme assurant la transmission verticale de Wolbachia chez leurs hôtes, à savoir plus de 50 % des espèces d'arthropodes. Dans le cas de l'IC, les oeufs non infectés par Wolbachia ne se développent pas lorsqu'ils sont fécondés par le sperme de mâles infectés. Seules les femelles infectées, dont les oeufs hébergent Wolbachia, produisent des embryons viables avec des mâles infectés par la même souche de Wolbachia. L'IC est utilisée dans la lutte antivectorielle, notamment contre les moustiques, par le biais de la technique de l'insecte incompatible. Les effecteurs de d'IC sont les gènes appelés cif, organisés en opérons A-B. Chacun des gènes d'un opéron cif appartient à une famille multigénique monophylétique, diversifiée en 10 grands types. L'amélioration récente des techniques de séquençage à haut débit, notamment celles produisant des long reads, a permis l'assemblage de génomes de Wolbachia induisant l'IC chez les arthropodes dont ceux des moustiques communs (Culex pipiens) et du moustique tigre (Aedes albopictus). La plupart de ces génomes hébergent dans différentes zones prophagiques des opérons cif appartenant à différents types, soulevant la question du rôle et de l'évolution de cette diversité d'effecteurs cif au sein d'un même génome de Wolbachia.

Pourquoi différents gènes cif sont-ils maintenus au sein d'un même génome de Wolbachia ? Quelle est la contribution des différents types de cif au mécanisme d'IC chez les moustiques ? Quels défauts embryonnaires chacun provoque-t-il ?
Afin de répondre à ces questions, ce projet de thèse s'appuie sur une approche intégrative combinant des approches évolutives et fonctionnelles de l'IC chez les moustiques (génomique de Wolbachia, caractérisation des phénotypes d'IC grâce à des croisements entre lignées de moustiques, distribution des protéines dans les organes reproducteurs et les gamètes).

- Croisements entre lignées de moustiques
- Immunomarquages des effecteurs cif dans les gonades et les gamêtes
- Analyses cytologiques du développement précoce de l'embryon
- Génomique : assemblage et annotation de génomes bactériens à partir de données de séquençage longs-fragments (PromethION + Nanopore)