Thèse Gene Gating Plus Qu'Une Hypothèse H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : IGH - Institut de Génétique Humaine
Direction de la thèse : Charlène BOUMENDIL
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Nuclear pores are massive protein assemblies, which main function is to ensure nucleocytoplasmic transport of proteins, RNAs and metabolites. Fourty years ago, Blobel proposed the gene gating hypothesis, stating that active genes would associate with the nuclear pores to ensure coupling between active transcription and mRNA export. While this gene gating mechanism has been recently demonstrated to regulate the expression of the Myc oncogene in cancer cells, major informations are still lacking: what are the genomic regions subjected to gene gating, how are they modified during development and/or pathogenesis, and what are the molecular memchanisms underlying gene gating. The PhD student will address these questions at different scales, from the single locus scale to genome-wide scale by a combination of state of the art genomic approaches combined to single molecule live cell imaging on single loci.

Les pores nucléaires sont d'imposants complexes protéiques dont la fonction principale est d'assurer le transport nucléocytoplasmique des protéines, des ARN et des métabolites. Il y a quarante ans, Blobel a proposé l'hypothèse du « gene gating », selon laquelle les gènes actifs s'associeraient aux pores nucléaires pour assurer le couplage entre la transcription active et l'exportation de l'ARNm. Bien qu'il ait récemment été démontré que ce mécanisme de « gene gating » régule l'expression de l'oncogène Myc dans les cellules cancéreuses, des informations essentielles font encore défaut : quelles sont les régions génomiques soumises au « gene gating », comment sont-elles modifiées au cours du développement et/ou de la pathogenèse, et quels sont les mécanismes moléculaires sous-jacents? Le doctorant abordera ces questions à différentes échelles, de l'échelle d'un locus unique à l'échelle du génome, en combinant des approches génomiques de pointe avec l'imagerie de cellules vivantes à l'échelle moléculaire sur des loci individuels.

Connaissances approfondies en biologie, notamment dans les domaines de l'épigénétique et de l'organisation de la chromatine.
Langue anglaise niveau B1
Savoir concevoir, mettre en oeuvre et adapter des techniques de biologie cellulaire et moléculaire avec rigueur et en autonomie
Savoir analyser et interpréter des données experimentales, des compétences en analyse bioinformatiques seraient un plus
Capacité à présenter ses travaux en anglais, à l'oral et à l'ecrit
Capacité à prendre des initiatives et à développer un projet scientifique
Tenir un cahier de laboratoire de manière rigoureuse
Savoir travailler en équipe, dans le respect des différences de chacun
Excellent sens de l'organisation
Capacité de raisonnement analytique
Excellente capacité d'apprentissage, curiosité scientifique et motivation
Respect le plus strict des normes éthiques et intégrité scientifique