Thèse Rôle des Interactions Entre Cellules Épithéliales et Microenvironnement dans la Tumorigenèse Digestive H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé Laboratoire de recherche : IGF - Institut de Génomique Fonctionnelle Direction de la thèse : François GERBE ORCID 0000000250068930 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59 L'intestin joue un rôle critique de barrière contre les agressions du milieu extérieur (agents pathogènes, toxines...) et met en jeu des régulations complexes et finement régulées entre le microenvironnement constitué de l'ensemble des microorganismes présents dans la lumière intestinale, les cellules de l'épithélium intestinal, et les cellules immunitaires. Un déséquilibre dans ces interactions conduit à diverses pathologies de l'épithélium intestinal (maladies inflammatoires chroniques et cancer).

Notre équipe s'intéresse spécifiquement aux cellules tuft de l'épithélium intestinal. Après avoir caractérisé ces cellules et leurs voies de différenciation (Gerbe et al, J. Cell. Biol. 2011), notre équipe a découvert leur première fonction consistant à initier une réponse immunitaire de type 2 suite à une infection parasitaire (Gerbe et al, Nature 2016). Plus récemment, nous avons aussi découvert la capacité des cellules tuft dans le sensing de changements de compositions microbiennes, participant à la mise en place d'une dysbiose intestinale, (Coutry et al, PNAS 2023), ainsi que la fonction effectrice des cellules tuft, après amplification cellulaire lors de la réponse immune de type 2 (Ndjim et al, Immunity, 2024). Ces cellules constituent donc des acteurs clé de la régulation de l'activité du système immunitaire mucosal, mais leur rôle dans les maladies intestinales reste encore méconnu.

Cette thèse aura pour objectif de comprendre le rôle des cellules tuft dans des situations pathologiques telles que les cancers gastriques et intestinaux, en relation avec l'exposition à des agents pathogènes. Nous souhaitons en particulier déterminer quels sont les mécanismes permettant aux cellules tuft d'induire un environnement pro-inflammatoire, favorisant l'initiation tumorale.

Nous souhaitons comprendre comment certaines populations de cellules épithéliales, nommées cellules tuft, interagissent avec le microenvironnement, incluant le microbiote digestif et certains pathogènes, et pourraient réguler la réponse immunitaire et inflammatoire dans un contexte de carcinogenèse digestive. Déterminer le lien entre environnement, inflammation et initiation de la tumorigenèse intestinale. Histologie, biologie moléculaire, expérimentation animale, culture d'organoides, approches multi-omiques

Habilitation à l'expérimentation sur rongeurs, niveau concepteur ou applicateur
Capacité de communication
Notion en histologie et biologie moléculaire, immunité ainsi qu'en génétique murine