Thèse le Rôle des Protéines Désordonnées dans le Transfert des Lipides au Niveau des Sites de Contact Membranaire chez la Levure Bourgeonnante H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : CRBM - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier
Direction de la thèse : Alenka COPIC ORCID 0000000301667731
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Les sites de contact membranaire sont des zones de contact étroit entre deux compartiments cellulaires et constituent des plaques tournantes essentielles pour le transfert des lipides à travers le cytosol. En particulier, le réticulum endoplasmique (RE), principal site de synthèse des lipides dans les cellules, est en contact avec pratiquement tous les autres compartiments cellulaires. Les protéines de transfert des lipides, qui interviennent dans le transfert des lipides au niveau des sites de contact membranaire, sont souvent directement fixées aux membranes ou se localisent dans ces régions par le biais d'interactions avec d'autres protéines de liaison membranaire - ainsi nommées en raison de leur capacité à se fixer simultanément à deux membranes. Il est intéressant de noter que les protéines de liaison membranaire contiennent souvent des régions intrinsèquement désordonnées (IDR) et que les sites de contact membranaire semblent riches en protéines contenant des IDR. Dans le cadre de ce projet, nous étudierons comment les protéines de transfert lipidique interagissent avec les IDR et comment ces dernières influencent leur activité au niveau des sites de contact membranaire. Les IDR étant souvent phosphorylées, nous examinerons également comment la phosphorylation des protéines influe sur l'interaction entre les protéines de transfert lipidique et les ancrages membranaires désordonnés, ainsi que la manière dont ces paramètres sont régulés par des conditions environnementales telles que la disponibilité des nutriments et la température. Le projet se concentrera sur deux sites de contact spécifiques : celui entre le RE et la membrane plasmique, et celui entre la membrane du RE, la gouttelette lipidique et la vacuole, dans le modèle de la levure bourgeonnante, en s'appuyant sur les travaux antérieurs menés au sein du laboratoire. Nous recourrons à la génétique de la levure et à la biologie moléculaire pour manipuler les interactions protéiques et les voies métaboliques des lipides, ainsi qu'à l'imagerie par fluorescence et à des tests de croissance de la levure pour analyser l'impact sur la localisation des protéines, l'organisation des sites de contact membranaires et la distribution des lipides cellulaires, ainsi que des approches biochimiques et bioinformatiques visant à étudier le comportement des protéines IDR et l'impact de la phosphorylation protéique. De plus, le projet peut être élargi pour inclure des approches structurales avancées permettant d'évaluer les IDR et les interactions entre les IDR et les protéines solubles (expertise de N. Sibille).

The cellular biology of membrane contact sites and their role in lipid homeostasis represents a highly active field of research, with important implications for human disease. The budding yeast has been an essential model system for the studies in this field. An equally active field of research are the studies of intrinsically-disordered protein regions, which are present in many proteins and are particularly-enriched in membrane interacting proteins.

Master en biologie cellulaire, biologie moléculaire et génétique ou en biochimie
Bonnes aptitudes analytiques, quantitatives et de présentation, formation en biologie cellulaire et en biochimie, passion pour les sciences expérimentales