Thèse Cartographie du Paysage Protéique des Sites de Contact Membranaires Entre Organites et leurs Perturbations dans le Cancer du Sein H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé Laboratoire de recherche : CRBM - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier Direction de la thèse : Stéphane BODIN ORCID 000000030926403X Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59 Les sites de contact membranaires (MCS) sont des structures fonctionnelles où les membranes de deux organites sont espacées de 10 à 30 nm, facilitant ainsi les échanges de matériaux, le positionnement et la fission des organites, ainsi que la communication inter-organites. Le réticulum endoplasmique (RE), un vaste réseau de tubules et de feuillets membranaires, établit des contacts étendus avec la membrane plasmique et la plupart des organites, jouant un rôle essentiel dans la fonction cellulaire. Les MCS sont au coeur de processus clés tels que le transport des lipides, l'homéostasie du calcium, le positionnement des endosomes et l'autophagie.
L'étude des MCS est un domaine en pleine expansion en biologie cellulaire, ces structures étant désormais reconnues comme des hubs privilégiés de communication et d'échange entre organites. Cependant, l'organisation des sites de contact dans la cellule reste une question majeure non résolue. Pour comprendre pleinement la régulation et la dynamique de ces structures essentielles, il est indispensable d'identifier les mécanismes moléculaires et biochimiques qui gouvernent leur fonctionnement.
Les contacts inter-organites sont médiés par des protéines d'ancrage qui relient les membranes de deux organites via des interactions protéine-protéine ou protéine-membrane. L'identification de ces protéines d'ancrage est cruciale pour comprendre comment les MCS sont structurés et comment ils contribuent à l'architecture et à la fonction cellulaires.
Dans notre laboratoire, nous nous intéressons à l'architecture des cellules normales et cancéreuses. Nous avons identifié de nouvelles protéines qui s'assemblent en complexes pour former des sites de contact entre le RE et d'autres organites cellulaires. Fait intéressant, certaines de ces protéines sont altérées dans le cancer, en particulier le cancer du sein, suggérant que ces mécanismes sont perturbés dans les cellules tumorales.
L'objectif de ce projet est d'établir une cartographie des protéines impliquées dans la formation des contacts inter-organites en combinant des approches d'imagerie et de biochimie.
Les dérégulations du trafic membranaire et vésiculaire sont connues pour favoriser le développement tumoral. Un aspect récent de la dynamique membranaire concerne les interactions entre organites (réticulum endoplasmique, membrane plasmique, endosomes, gouttelettes lipidiques, mitochondries, ...) qui se produisent au niveau de structures dynamiques appelées sites de contacts membranaires (membrane contact sites : MCS). Ces sites permettent l'échange de différentes molécules, notamment des lipides et des ions. La formation et la dynamique des MCS sont contrôlées par des complexes protéiques spécifiques. L'équipe est pionnière dans l'étude de ces machineries et possèdent une expertise reconnue dans ce domaine au niveau international. Toutefois, les mécanismes régulant ces machineries restent encore mal compris. Nos travaux ont déjà montré que la dérégulation de certaines protéines impliquées dans la dynamique des MCS contribue au développement tumoral, suggérant qu'elles pourraient constituer des cibles thérapeutiques potentielles. Ce projet de thèse s'inscrit dans le programme de l'équipe qui vise à décrypter les mécanismes de régulation des complexes protéiques contrôlant la formation et la dynamique des MCS entre différents organites cellulaires.

Dysregulation of membrane and vesicular trafficking is known to contribute to tumor development. A recent aspect of membrane dynamics involves interactions between membrane-bound organelles (endoplasmic reticulum, plasma membrane, endosomes, lipid droplets, mitochondria, etc.), which occur at dynamic structures called membrane contact sites (MCS). These sites facilitate the exchange of various molecules, particularly lipids and ions, thereby modulating organelle properties and cellular homeostasis.
The formation and dynamics of MCS are regulated by specific protein complexes. Our team is a pioneer in the study of these complexes and has internationally recognized expertise in the field. However, the mechanisms controlling these machineries remain poorly understood. Our research has already shown that the dysregulation of certain proteins involved in MCS dynamics contributes to tumor development, suggesting that they could serve as potential therapeutic targets.
This doctoral project is part of the team's broader effort to decipher the regulatory mechanisms of protein complexes controlling the formation and dynamics of MCS between different cellular organelles
L'objectif de ce projet est d'établir une cartographie des protéines impliquées dans la formation de sites de contact entre le réticulum endoplasmique et les autres organites cellulaires.

The goal of this project is to establish the landscape of proteins involved in the formation of contact sites between the endoplasmic reticulum and other cellular organelles
Le projet repose sur des méthodes de biologie cellulaire, en particulier de la microscopie cellulaire à fluorescence (confocal, spinning disk, FRAP, ...) couplée à de l'analyse d'images, et de biochimie, en particulier une combinaison de méthodologies de pointe permettant d'identifier et de caractériser les interactions protéine-protéine (immunoprécipitation, biotinylation de proximité couplée à la spectrométrie de masse).

The project relies on cell biology methods, particularly fluorescence microscopy (confocal, spinning disk, FRAP, etc.) coupled with image analysis, as well as biochemical techniques, including a combination of cutting-edge methodologies to identify and characterize protein-protein interactions (immunoprecipitation, proximity biotinylation coupled to mass spectrometry).

Bonne maîtrise des concepts en biochimie, biologie moléculaire et biologie cellulaire.
Bonnes capacités de communication écrite et orale en anglais
Être motivé et intéressé par le projet du laboratoire.