Thèse Caractérisation des Mécanismes Moléculaires Conduisant à l'Atg8ylation au Cours de la Transmission du Vih-1 Via la Synapse Virologique H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé Laboratoire de recherche : IRIM - Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier Direction de la thèse : Lucile ESPERT ORCID 0000000190679034 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59 Le VIH-1 infecte ses cellules cibles sous forme de particules libres ou après leur contact avec une cellule infectée via l'utilisation d'une structure spécifique appelée synapse virologique (SV). Ce dernier mode d'infection est très efficace car il favorise l'échappement immunitaire et réduit l'efficacité de certains traitements.
Les travaux de notre équipe s'intéressent aux interactions entre le VIH-1 et le mécanisme cellulaire d'atg8ylation (conjugaison des protéines de la famille ATG8, notamment LC3B, aux membranes cellulaires), initialement identifié dans le processus d'autophagie. Nos résultats récents montrent que l'atg8ylation favorise l'entrée du VIH-1, sous forme de particule libre, dans les lymphocytes T CD4+. Nos résultats récents montrent que ce processus favorise également la transmission du VIH-1 via la SV. D'une part, nous avons observé un enrichissement de dots de LC3B au niveau de cette structure et, d'autre part, nous avons montré que l'atg8ylation favorise le transfert viral depuis la cellule infectée vers la cellule cible. Fait important, dans ce dernier contexte, nous avons également mis en évidence l'apparition d'une structure tout à fait originale, que nous avons appelée « patch-LC3B », qui se forme au niveau de la SV dans plus de 50% des cellules cibles en contact avec des cellules infectées. La caractérisation de cette structure, actuellement encore en cours, montre qu'il s'agit d'une vésicule d'environ 1 µm3, positive pour les protéines LC3B, EEA1 et Rab7a, mais qu'elle n'est pas acide (négative pour LAMP1 et pour un marquage au Lysotracker en live-cell imaging). Des expériences d'imagerie en super-résolution (STED et FIB-SEM) nous ont permis d'observer que cette vésicule contient des particules virales entière.
Dans ce contexte, les objectifs de la thèse proposée sont de :
- Déterminer avec précision la nature du patch-LC3B.
- Rechercher les évènements moléculaires induits par le virus qui initient la formation du patch-LC3B.
- Rechercher les signaux induits par le virus et qui conduisent au recrutement de la machinerie d'atg8ylation au niveau de cette vésicule.
Différents modèles cellulaires complémentaires (lignées infectées, cellules éditées par CRISPR-KI exprimant GFP-LC3B, lymphocytes T CD4+ primaires) et viraux (cellules chroniquement infectées par le VIH-1, souche X4 et R5) seront utilisés pour répondre aux questions posées. Ces travaux apporteront des connaissances fondamentales sur la transmission du VIH-1 via la SV et pourraient ouvrir la voie à de nouvelles stratégies thérapeutiques ciblant les réponses cellulaires à l'infection plutôt que la seule réplication virale. Le projet sera développé au sein de l'IRIM dans l'équipe AMI (Autophagy Machinery in Infections). Notre équipe est experte dans l'analyse du rôle de la machinerie d'atg8ylation au cours des infections virales. En particulier, nous avons récemment montré que ce processus favorise l'entrée, par fusion à la membrane plasmique, du VIH-1 dans les lymphocytes T CD4+.
L'objectif de cette thèse est d'identifier des mécanismes moléculaires conduisant à l'atg8ylation, processus favorisant la transmission du VIH-1 via la synapse virologique.
Biologie cellulaire, moléculaire et biochimie. Microscopie à fluorescence sur cellules vivantes infectées. Les infections par le VIH-1 se feront en zone de confinement de type 3 (BSL3). Une formation sera dispensée à l'étudiant(e) à cet effet.

Master 2 ou Equivalent