Thèse Trajectoire Évolutive et Adaptaions Écologiques de la Levure Modèle S. Pombe H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier
École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé
Laboratoire de recherche : CRBM - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier
Direction de la thèse : Dominique HELMLINGER ORCID 0000000315010423
Début de la thèse : 2026-10-01
Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59

Comprendre comment les variations génétiques se traduisent en traits phénotypiques est une question importante en biologie. Notre connaissance des mécanismes sous-jacents provient essentiellement de travaux réalisés sur quelques organismes modèles, propagés sous forme de souches isogéniques dans des conditions contrôlées. Or, inclure le contexte écologique et la diversité génétique et phénotypique présente dans les souches sauvages est essentiel pour faire avancer ce domaine de recherche.

Dans ce projet de thèse, nous proposons d'aborder cette question pour l'organisme modèle Schizosaccharomyces pombe et plus largement pour le clade des levures fissipares, dont l'histoire naturelle est peu connue. Ces levures ont divergé des levures bourgeonnantes il y a 500 millions d'années et des analyses comparatives ont apporté des informations complémentaires sur des processus fondamentaux. Nous avons récemment découvert, avec d'autres, que les levures fissipares sont enrichies dans les
ressources alimentaires des abeilles, comme le miel, fournissant un réservoir de variations naturelles et un indice sur leur histoire naturelle. Nous postulons que ces levures ont établi des interactions étroites avec les abeilles et acquis des traits phénotypiques permettant leur adaptation à des environnements à forte pression osmotique, une caractéristique majeure de ces substrats. Nous avons ainsi développé un projet interdisciplinaire combinant des expertises en génétique des levures (CRBM, Montpellier) et en écologie des pollinisateurs (CEFE, Montpellier), afin d'explorer la base génétique de cette adaptation et les effets écologiques des levures fissipares dans cette niche. Plus précisément, nos objectifs sont de comprendre comment ces levures modulent leur cycle haploïde-diploïde et répondent à une osmolarité élevée dans cet environnement, et d'étudier leur impact sur le succès reproducteur des abeilles. Nous espérons que notre projet fournira un contexte évolutif à la biologie de la levure fissipare et un cadre méthodologique à l'étude des bases génétiques et de la pertinence écologique des traits phénotypiques chez la levure.

Research in fission yeast biology is at the dawn of a new era. First, thanks to the availability of a large collection of natural and domestic isolates, we are primed to leverage the natural variation within the fission yeast clade to discover new features of genome evolution and function. Honey has a very high osmotic pressure, or low water activity, because of the high levels of sugars, mainly fructose and glucose. Therefore, fission yeasts should display phenotypic traits that allowed them to thrive, at least temporarily, in this environment. Moisture and water activity vary substantially during honey maturation, as well as between individual honeycombs, seasons, and latitudes. These
variations would allow fission yeasts to proliferate and colonize this niche. However, little is known about how eukaryotic cells adapt to such extreme osmotic pressure, which is the mainsquestion that we will address in this project. Overall, our project provides a timely opportunity to bring a natural history context to a prime model organism and to test ecologically-relevant phenotypes in a genetically

Master en Génétique, Biologie moléculaire et cellulaire, ou Ecologie & Evolution
Des notions de génétique quantitative, phylogénomique et/ou de bioinformatique sont un plus.