Thèse Influence de la Chromatine sur la Sécrétion Protéique à Travers les Voies Métaboliques Contrôlant la Glycosylation H/F - Doctorat.Gouv.Fr

Établissement : Université de Montpellier École doctorale : Sciences Chimiques et Biologiques pour la Santé Laboratoire de recherche : CRBM - Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier Direction de la thèse : Dominique HELMLINGER ORCID 0000000315010423 Début de la thèse : 2026-10-01 Date limite de candidature : 2026-05-11T23:59:59 La glycosylation des protéines est une modification post-traductionnelle permettant leur maturation et leursécrétion. Elle influence le comportement des cellules, la réponse immunitaire, et est impliquée dans de nombreux processus pathologiques. Pourtant, les mécanismes transcriptionnels et métaboliques quirégulent la glycosylation restent mal compris. Ce projet de thèse s'intègre à un projet plus global visant à élucider comment le complexe chromatinien conservé Tip60 orchestre un programme métabolique alimentant la glycosylation pour contrôler la sécrétion protéique dans des contextes développementaux et inflammatoires.

En collaboration avec le groupe de Patrick Jouandin (IRCM, Montpellier), nous allons combiner fluxomique et génomique fonctionnelle dans des modèles de Drosophile et des cellules humaines afin de cartographier les voies métaboliques contrôlant la glycosylation, en analysant leurs flux et leur régulation transcriptionnelle. Nos données préliminaires montrent que Tip60 module l'expression d'enzymes métaboliques et de glycosyltransférases, impactant la composition des glycannes et la sécrétion de signaux clés pour l'immunité. Nous avons développé des outils innovants pour suivre les flux métaboliques, et des approches de génomique fonctionnelle pour identifier les cibles directes de Tip60.

Ce projet permettra de mieux comprendre comment l'état chromatinien influence les fonctions métaboliques, et la communication cellulaire via les glycannes. Il apportera des méthodes transférables à d'autres systèmes biologiques et contribuera à révéler de nouveaux mécanismes impliqués dans les pathologies liées à Tip60 et à la glycosylation. Glycans are widespread and diverse sugar motifs that modulate protein folding, trafficking, cell identity, and immune communication. Disruptions in glycan patterns are linked to cancer, autoimmunity, infection, and immune evasion. Although the enzymatic steps of glycan assembly are well described, the upstream regulatory logic that coordinates the metabolic pathways supplying glycan precursors with the transcriptional programs specifying glycan structures remains largely unknown. Addressing this issue is therefore critical for understanding how glycosylation states are established, maintained, and perturbed in health and disease.

Master en Génétique, Biologie moléculaire et cellulaire, ou Biochimie.
Des notions de génomique fonctionnelle dans les cellules humaines et/ou de bioinformatique sont un plus.