Chercheur en Biologie Intégrative des Écosystèmes Marins H/F - Ifremer

Rejoignez l'Ifremer pour un océan mieux compris, mieux protégé qui demeure un allié du bien-vivre sur la planète

Des abysses à la surface, de la côte au large, l'Ifremer est l'institut de recherche français entièrement dédié à l'Océan. Ses équipes mènent des recherches, innovent et produisent des expertises pour protéger l'océan, exploiter ses ressources de manière responsable et partager les données marines.

L'Ifremer apporte son expertise scientifique pour éclairer les politiques publiques et élabore des solutions puisées dans l'océan pour répondre aux enjeux de la transition écologique. Opérateur de la Flotte océanographique française avec sa filiale d'armement Genavir, l'Ifremer imagine, conçoit et déploie des moyens technologiques de pointe pour percer les mystères de l'océan.

Rejoignez nos équipes, composées de 1500 scientifiques et métiers supports à la recherche, et présentes sur tout le littoral métropolitain et en Outre-mer.

www.ifremer.fr

Date de clôture de réception de candidatures : 21/05/2026

Qui sommes-nous ?

Le laboratoire IHPE (Interactions Hôtes Pathogènes Environnements) est une unité mixte de recherche (Université de Perpignan Via Domitia, CNRS, Ifremer, Université de Montpellier) qui développe des approches multi-échelles - des molécules aux populations naturelles - pour comprendre les interactions entre hôtes, pathogènes et/ou environnements. Son ambition est de contribuer à une santé globale selon le principe « Une Planète - Une Santé - Un Océan », à travers des projets phares sur l'aquaculture durable, les récifs coralliens et les maladies tropicales négligées. Reconnue à l'échelle nationale et internationale, l'unité s'appuie sur des plateformes technologiques de pointe, un réseau de collaborations en Europe, Amérique du Sud, Afrique et Pacifique, et un fort engagement en faveur de la qualité de vie au travail et de l'égalité des chances.
https://ihpe.umontpellier.fr/

Placé-e au sein de l'unité de recherche Ifremer IHPE et de l'UMR 5244 IHPE, vous développerez des approches intégratives pour comprendre et prédire l'évolution des interactions dans les océans, dans le contexte "One World-One Health-One Ocean".

Quelle sera votre mission ?

Votre mission consistera à développer, coordonner et valoriser des projets de recherche collaboratifs et interdisciplinaires au sein du laboratoire Interactions Hôtes Pathogènes Environnements (IHPE). Vous contribuerez à la compréhension des interactions complexes entre les organismes marins, leurs agents pathogènes et/ou leur environnement dans un contexte de changement global, en mobilisant des approches intégratives et multi-échelles (de la molécule aux populations), notamment omiques (génomique, épigénétique, transcriptomique, protéomique et/ou métabolomique), ainsi que des outils avancés de bioanalyse. Un intérêt pour la biologie des systèmes, la modélisation sera apprécié, sans être requis.

Vous participerez activement au rayonnement scientifique du laboratoire et au renforcement de ses collaborations nationales et internationales.

Quelles seront vos activités ?

- Concevoir, développer et coordonner des projets de recherche interdisciplinaires visant à comprendre les interactions entre les hôtes aquatiques, leurs agents pathogènes et/ou leur environnement.

- Mettre en oeuvre des approches multi échelles (des molécules aux populations) et intégratives, omiques (génomique, épigénétique, transcriptomique, protéomique, et/ou métabolomique) pour analyser les dynamiques biologiques et écologiques des systèmes étudiés.

- Réaliser et superviser des analyses bioinformatiques et bioanalytiques complexes afin d'extraire, d'intégrer et d'interpréter les données issues du terrain ou des expériences en conditions contrôlées.

- Contribuer directement ou via des collaborations à la modélisation et à la prévision des processus écologiques et évolutifs en lien avec les changements environnementaux.

- Animer et fédérer des collaborations nationales et internationales, en assurant la coordination scientifique et la valorisation des résultats de recherche.

- Participer à la diffusion, à la publication et à la valorisation des travaux dans des revues à comité de lecture, colloques et réseaux professionnels.

- Contribuer à la formation et à l'encadrement des étudiants, doctorants et jeunes chercheurs dans les domaines de la biologie intégrative et des sciences omiques.

Avec qui allez-vous travailler ?

- En interne : Ifremer SEBIMER, Pôle systèmes d'information et bio-informatique (IHPE), unités Ifremer MARBEC, ASIM, EMMA, PHYTNESS/UMR LEMAR, RPMF et LEAD-NC

- En externe : collaborateurs nationaux et internationaux des projets de recherche

Qui êtes-vous ?

- Vous êtes titulaire d'un doctorat en biologie, bioinformatique, génomique, écologie ou dans un domaine connexe des sciences du vivant.
- Une expérience postdoctorale est requise, une expérience des approches intégratives et/ou omiques sera appréciée.

Vous avez les compétences, connaissances et expériences suivantes :

- Compétences scientifiques : Vous disposez d'une expertise confirmée en analyses (epi)génomiques, transcriptomiques, protéomiques et/ou métabolomiques, ainsi qu'en bioanalyse et traitement de données complexes issues de ces approches.
- Expérience de montage de projets de recherche et capacité à créer des réseaux de collaboration nationaux et/ou internationaux sur vos sujets d'étude.

- Compétences techniques : Maîtrise des outils de bioinformatique, et de biostatistique (R, Python, plateformes de calcul, outils d'intégration multi-omique).

- Compétences méthodologiques et transversales : Capacité à concevoir des approches interdisciplinaires, à intégrer des données multi-niveaux (moléculaire, physiologique, écologique) et à développer des analyses à forte composante computationnelle.

- Communication scientifique : Excellentes capacités de rédaction, de présentation et de valorisation des résultats dans un contexte national et international.

- Langues : Maîtrise de l'anglais scientifique, à l'écrit comme à l'oral.

Vous avez les qualités suivantes :

- Capacité à travailler en équipe et à collaborer avec des partenaires multidisciplinaires (biologistes, écologues, bioinformaticiens, modélisateurs)

- Rigueur scientifique et sens de l'organisation.

- Curiosité, créativité et esprit d'analyse pour résoudre des problèmes complexes.

- Aptitude à communiquer en anglais scientifique.

- Sens de la responsabilité et engagement dans la qualité du travail et la valorisation des résultats.