Les missions du poste


Description du Poste Les Missions Assurer la curation scientifique, le contrôle qualité et la mise à jour continue des bases IMGT/mAb-DB, IMGT/2Dstructure-DB et IMGT/3Dstructure-DB. Intégrer les nouvelles entrées issues des listes WHO International Nonproprietary Names (INN). Suivre les autorisations réglementaires délivrées par la FDA et l'EMA et mettre à jour les entrées correspondantes dans les bases IMGT. Annoter les structures d'anticorps pertinentes déposées dans la Protein Data Bank (PDB) conformément aux standards IMGT. Actualiser IMGT/3Dstructure-DB en intégrant les nouvelles structures disponibles dans la PDB, en assurant le contrôle qualité des données et la cohérence des annotations existantes. Maintenir des données standardisées, cohérentes et traçables au sein des trois ressources IMGT. L'Activité Surveiller les listes WHO INN afin d'identifier et de curer les nouvelles protéines immunologiques à intégrer dans les bases IMGT. Suivre les autorisations réglementaires de la FDA et de l'EMA et mettre à jour les entrées correspondantes dans les bases IMGT. Collecter, valider et annoter les séquences d'acides aminés et les structures tridimensionnelles de protéines immunologiques conformément aux standards IMGT. Développer et maintenir les workflows de curation, en garantissant la qualité des données, la traçabilité des sources et la cohérence entre IMGT/mAb-DB, IMGT/2Dstructure-DB et IMGT/3Dstructure-DB. Assurer une veille scientifique et intégrer les nouvelles données pertinentes dans les bases IMGT. Identifier et résoudre les problèmes techniques liés aux bases de données IMGT. Créer et mettre à jour les pages web pertinentes. Assurer une veille scientifique et technique, documenter les activités de curation et contribuer aux nouvelles versions des bases, aux rapports scientifiques et aux publications. Votre Profil Compétences Connaissances en immunologie, bioinformatique et bases de données biologiques. Expérience dans l'utilisation d'outils bioinformatiques et dans l'analyse de séquences biologiques. Maîtrise des outils Microsoft Office (Excel, Word et PowerPoint). Capacité à travailler de manière autonome et à collaborer efficacement au sein d'une équipe. Bonne maîtrise de l'anglais écrit et oral. Compétences en programmation (Python, Perl ou langage similaire). Expérience en gestion de bases de données et en SQL. Connaissances en technologies web (HTML, CSS). Expérience en scripting et en automatisation de workflows. Votre Environnement de Travail IMGT® (International ImMunoGeneTics Information System®) fournit des bases de données de référence ainsi que des outils dédiés à l'immunogénétique et à l'immunoinformatique. Le poste consiste à assurer la curation scientifique, la maintenance et la mise à jour continue de trois bases de données IMGT : IMGT/mAb-DB, IMGT/2Dstructure-DB et IMGT/3Dstructure-DB. Les principales responsabilités comprennent l'intégration de nouvelles données relatives aux protéines immunologiques issues des listes WHO INN (International Nonproprietary Names), le suivi des autorisations réglementaires délivrées par la FDA et l'EMA, ainsi que l'annotation de séquences protéiques et de structures tridimensionnelles conformément aux standards IMGT. La personne recrutée veillera à la qualité, à la traçabilité et à la cohérence des données entre ces différentes bases, tout en contribuant à leur développement et à leur diffusion scientifique. L' IGH est situé sur le campus Arnaud de Villeneuve, partie prenante du programme Objectif Employeur Pro-Vélo. Contraintes et risques Travail exclusivement sur ordinateur. Rémunération et avantages Rémunération A partir de 3175€ brut mensuel ajustable en fonction de l'expérience professionnelle sur des postes de niveau équivalent Congés et RTT annuels 44 jours Pratique et Indemnisation du TT Pratique et indemnisation du TT Transport Prise en charge à 75% du coût et forfait mobilité durable jusqu'à 300€ À propos de l'offre Référence de l'offre UMR9002-SOFKOS-064 Secteur d'activité Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement Emploi type Ingenieur biologiste en analyse de donnees (H/F) À propos du CNRS Le CNRS est un acteur majeur de la recherche fondamentale à une échelle mondiale. Le CNRS est le seul organisme français actif dans tous les domaines scientifiques. Sa position unique de multi-spécialiste lui permet d'associer les différentes disciplines pour affronter les défis les plus importants du monde contemporain, en lien avec les acteurs du changement. Le CNRS Les métiers de la recherche

Compétences requises

  • SGBD
  • Python
  • Programmation
  • Anglais
  • Gestion de base de données
  • Perl
  • Veille scientifique
  • Excel
  • HTML
  • Word
  • Analyse de données
  • PowerPoint
  • Contrôle qualité
  • SQL
  • Bio-informatique
  • Scripting
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